포니, 페가수스, 유니콘이 함께 조화를 이루며 살던 이퀘스트리아.
하지만 평화가 사라져버린 그곳, 신비로운 마법의 힘마저 잃었다. 예전처럼 모두가 친구가 될 수 있다고 믿는 어스 포니 `써니`에게 신비한 뿔을 가진 유니콘 `이지`가 나타나고, 운명처럼 친구가 된 둘은 잃어버린 이퀘스트리아의 마법과 우정을 되찾기 위해 머나먼 모험을 떠나는데…
과연, 친구들은 사라진 마법의 힘을 되찾을 수 있을까? 거대한 세계를 뒤바꿀 작은 포니들의 새로운 모험이 시작된다!